1991年，第一部正式作品为唐季礼导演的《魔域飞龙》，之后以1992年的《力王》打响名号；并开始往电影圈发展，后又在无线电视中出演《南拳北腿》等功夫武侠剧。

1997年，樊少皇除了在金庸武侠剧《天龙八部》中饰演了三位男主角之一的虚竹之外；还在青春武侠剧《少年英雄方世玉》中饰演了洪熙官，2000年，他再度返回电影圈发展，初期仍以武打片、动作片为主。

2004年8月，参与古装轻喜剧《刘姥姥外传》的拍摄，并在剧中塑造大反派孙耀祖这一角色。

2005年3月，樊少皇搭档曾宝仪主演青春偶像剧《等你一万年》。

2007年，担任《功夫无敌》的动作指导。

2008年，他在《叶问》中饰演的金山找入围第28届香港电影金像奖最佳男配角；4月，出演以梁祝故事为原型，融合了武侠以及青春偶像元素的影片《剑蝶》，6月，樊少皇在汇集功夫和厨艺的电影《功夫厨神》中，出演黄继祖；7月，与梁咏琪搭档，主演都市爱情喜剧《爱得起》，摇身变为校服店的裁缝；11月，搭档刘德华、徐熙媛主演动作电影《未来警察》，饰演大反派卡龙。

2009年4月，主演翻拍剧《新一剪梅》，塑造李耿明这一角色；出演《大内密探零零狗》，扮演大反派太监；7月，主演刘镇伟执导的爆笑爱情喜剧《越光宝盒》，出演张飞；在邱礼涛执导的《死神傻了》中，樊少皇饰演过儿哥；10月，在王晶执导的喜剧片《美丽密令》中，出演袁子丹；11月，樊少皇在叶问三部曲终结篇《叶问前传》中，出演大师兄叶天赐；12月，在李力持执导的功夫喜剧片《唐伯虎点秋香2》当中，饰演反派无量大师。

2010年7月，在叶伟信执导的新版电影《倩女幽魂》中，塑造冷峻外表和温情内心一体的夏雪风雷；10月，参与徐克执导的3D武侠电影《龙门飞甲》，片中饰演西厂“极恶杀手”马进良；参与张敏执导的古龙小说楚留香系列改编而成的新版《楚留香新传》，塑造老酒鬼胡铁花这一角色；11月，与陈键峰合作主演搞笑电视剧《财神有道》，饰演神仙明道；12月，参演由陈思成自编自导兼主演的都市剧《北京爱情故事》，樊少皇在片中塑造单亲爸爸秦皇这一人物。

2011年4月，加盟于正执导的古装战争剧《王的女人》，并在剧中赵国大将军子韧；5月，与陈国坤共同主演近代功夫剧《马永贞》，出演罗湛这一功夫角色；8月，樊少皇在改编自《聊斋志异》的《狐仙》中，出演痴情正直的燕赤霞；12月，客串田亮、杨幂、杜淳共同主演的体育公益电影《跑出一片天》，出演彪悍的体坛高手阿武；与迟帅合作，主演古装历史战争电视剧《薛丁山》，樊少皇塑造二路大军前路先锋罗通这一角色；同年，参演年代悬疑侦探剧《步步杀机》，饰演小文南父亲。

2012年4月，主演水浒人物谱之《石将军石勇》饰演石勇；与吴奇隆、马苏搭档，出演改编自梁羽生同名武侠小说的武侠电影《新白发魔女传》，塑造岳鸣珂这一角色；6月，在伏羲执导的黑色电影《猎仇者》中，出演坏人张金；11月，出演功夫电影《少年英雄》；7月，与杨幂搭档，出演都市商战悬爱作品《盛夏晚晴天》，塑造另类富二代夏晚阳。

2013年5月，出演战争题材电视剧《兄弟们上》，剧中饰演男一号石二龙；12月20日，樊少皇接拍了年代悬疑剧《执着的追踪》，饰演义匪胡大山 。

2014年10月搭档陈浩民、焦恩俊、樊少皇、周放参演由甘肃华盛文化影视有限责任公司制作拍摄，陇西籍国家一级作家王守义编剧，李翰韬导演的古代传奇电视剧《皇甫谧传奇》。

2015年1月，参演电视剧《蜀山战纪之剑侠传奇》，在剧中饰演公孙无我一角。

2016年4月，拍摄了以七年抗战为历史背景，讲述了名动华北的京剧戏班“盛家班的电视剧《一剑横空》。

2017年3月，与车永莉主演古装电影《天下第一镖局》；5月，主演了红色爱国主义教育题材电影《江城1943》；8月，与王德顺、王欣如、彭紫烊共同出演魔幻电影《九号战船》，在影片中饰演一位军功赫赫铁血柔情的父亲。

2018年1月，拍摄改编自金庸经典同名武侠小说的电视剧《倚天屠龙记》，樊少皇此次饰演反派角色成昆。

2019年1月24日，与穆婷婷主演的惊悚悬疑电影《姑获鸟》在爱奇艺播出。